Amostra questionada é aquela com origem conhecida e com a qual se deve comparar a amostra de referência que foi coletada em um local de crime, por exemplo.
Amostras biológicas se encontram preservadas mesmo em situações não favoráveis, pois o DNA é muito resistente; dessa forma, a variação ambiental não é fator limitante para análises.
A geração de um perfil de DNA a partir de restos mortais pode ocorrer apenas a partir de tecidos moles ou sangue, tanto na identificação de amostras como em testes de paternidade.
A identificação humana a partir do DNA baseia-se principalmente nas diferenças entre indivíduos em regiões não codificantes do genoma.