A escolha de áreas prioritárias para a conservação, utilização sustentável e repartição dos benefícios da biodiversidade deve levar em consideração aspectos como
vulnerabilidade: uma área é vulnerável se apresentar baixa iminência de erradicação de alvos de conservação.
insubstituibilidade: uma área é insubstituível se for a única capaz de garantir o cumprimento de metas estabelecidas para determinado alvo.
representatividade: áreas selecionadas devem conter todas as espécies que compõem a biodiversidade da região.
alvos de conservação: elementos da biodiversidade restritos às espécies de interesse para conservação.